化学蛋白质组学（Chemical Proteomics）作为蛋白质组学的一个重要分支，整合了合成化学、细胞生物学和质谱学多种方法，是利用能够与靶蛋白质发生特异性相互作用的化学小分子来研究和探测蛋白质组的技术。区别于以往的主要以蛋白质定性定量鉴定为基础的蛋白质组学技术，目前化学蛋白质组学技术的优势是能够在复杂体系（细胞裂解液、活细胞、组织等）中研究小分子与蛋白质的相互作用。
热蛋白质组学分析（Thermal proteome profiling ）是CETSA（Cellular thermal shift assay）中的一种主要方法。CETSA是一种检测细胞内药物与靶蛋白结合效率的实验，其原理是靶蛋白与药物分子结合时通常会变得稳定。即随着温度的升高，蛋白会发生降解；当蛋白结合药物后，相同温度下，未降解蛋白的量会提高，该复合蛋白的热熔曲线会右移。利用此原理，结合质谱法可以同时检测全蛋白质组在多个温度下的热变性状态，并绘制完整的熔化曲线，从而可以确定每种蛋白质的热位移变化。
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